IGV（IntegrativeGenomicsViewer）是一個(gè)部署在Java平臺上的基因組瀏覽器，用戶可以通過IGV瀏覽數(shù)據(jù)范圍內(nèi)的基因組序列，同時(shí)可以查看其他的相關(guān)信息，如基因注釋，引物、探針等等。

1.IGV軟件的界面介紹

IGV軟件的主要窗口分為6個(gè)部分，分別是基因組序列瀏覽區(qū)域、菜單欄、工具欄、軌道管理器、軌道信息顯示面板、軌道數(shù)據(jù)顯示面板。正確了解軟件界面的每個(gè)功能區(qū)域可以更好的使用軟件。

2.如何打開IGV軟件

如果您已經(jīng)下載了IGV軟件并已經(jīng)安裝成功，則直接雙擊啟動軟件即可，如果是第一次使用軟件，可能需要選擇“添加基因組”，然后輸入您要瀏覽的基因組序列信息進(jìn)行搜索。另外，IGV軟件的網(wǎng)址：https://www.broadinstitute.org/igv/

3.IGV軟件常用快捷鍵介紹

當(dāng)我們使用軟件時(shí)，常用快捷鍵可以幫助我們更快捷地操作，一些常用快捷鍵如下：

Ctrl+O：打開一個(gè)序列文件

Ctrl+D：將當(dāng)前序列復(fù)制一份

Ctrl+W：關(guān)閉當(dāng)前序列

Ctrl+F：按照某一個(gè)文件跳轉(zhuǎn)

Ctrl+A：全選序列

Ctrl+C：復(fù)制序列

4.IGV軟件如何全屏

在IGV軟件的菜單欄中，找到“View”選項(xiàng)，然后選擇“FullScreen”。您也可以使用“F11”快捷鍵實(shí)現(xiàn)全屏。當(dāng)您需要退出全屏?xí)r，再次點(diǎn)擊“View”選項(xiàng)，然后選擇“ExitFullScreen”或是按下“F11”即可退出全屏。

5.IGV軟件常見的應(yīng)用場景

IGV軟件可以用于基因突變的研究、轉(zhuǎn)錄組的分析以及表觀遺傳學(xué)的研究等，也可以用于研究軟件中的IDA、ChIP-seq等等。

6.IGV軟件的優(yōu)勢和缺點(diǎn)

IGV軟件具有強(qiáng)大的數(shù)據(jù)可視化和數(shù)據(jù)分析功能，在基因組序列瀏覽方面表現(xiàn)尤為突出；軟件易于安裝和使用，支持多種平臺、多種基因組瀏覽格式。

在一些特定數(shù)據(jù)類型的瀏覽方面，相對于其他軟件來說，如BAM文件格式的瀏覽，IGV軟件相對較為慢，而且軟件的可擴(kuò)展性比較差。

IGV軟件是一款功能強(qiáng)大的基因組瀏覽器，可以幫助研究者更好地研究基因組序列，同時(shí)也可以實(shí)現(xiàn)全屏瀏覽。希望此篇文章對您有所幫助。